Sobre
Soy un bioinformático especializado en tecnologías genómicas, secuenciación de nanoporos en tiempo real, análisis de señales, aprendizaje automático y hardware asociado. Tengo experiencia en desarrollo de software y más de una década de experiencia en la industria de la patología.
Liderando el desarrollo computacional dentro del Grupo de Tecnologías Genómicas del Centro de Genómica de Población en el Instituto de Investigación Médica Garvan, aplico mis habilidades únicas para desarrollar nuevas herramientas bioinformáticas, así como para diseñar y respaldar la infraestructura de secuenciación de nanoporos.
Mis áreas de investigación incluyen:
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Análisis de señal de nanoporos
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Pruebas clínicas y desarrollo de métodos.
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Trastornos de repetición corta en tándem
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Genómica viral (VIH/SARS-Cov-2)
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Secuenciación unicelular
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Secuenciación directa de ARN
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ensamblaje del genoma
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Detección de metilación
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Aprendizaje automático/profundo
Experiencia
Instituto Garvan / Analista de Sistemas Genómicos
junio de 2017 - PRESENTE, Darlinghurst
Cerebro Biosystems / Co-fundador y CTO
Octubre de 2017 - PRESENTE, Darlinghurst
Healius (Atención Primaria de Salud) / Senior Desarrollador de software
Diciembre de 2017 - PRESENTE, St Leonards
Instituto Garvan / Asistente de Investigación
Diciembre de 2016 - junio de 2017, Darlinghurst
Atención Primaria / Analista Programador
junio de 2015 - junio de 2017, St Leonards
Douglas Hanly Muaré Patología / Ayudante de laboratorio
2011 - 2015, Parque Macquarie
Davies Campbell De Lambert/Patología de Healthscope/Ayudante de laboratorio
2009-2011, Ryde
Premios
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2020 - Premio de póster finalista - London Calling
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2019 - Premio a la charla sobre iluminación - ABACBS/GIW
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2018 - Premio Innovación Palmer - Premio Garvan
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2017 - Premio J&J - Med Tech's Got Talent
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2017 - Premio Garvan: por ir 'más allá' en el apoyo a la cultura bioinformática en Garvan
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2017 - Premio al póster de última hora - Conferencia AGTA
Habilidades
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Linux/UNIX, BASH
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Python, R programación estadística, C, AHK, SQL
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diseño de algoritmos
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Informática de alto rendimiento (SGE)
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Bioinformática, ciencia de datos
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administración de sistemas, automatización, redes,\
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Sistemas de información de laboratorio (LIS)